Eze đã từng chơi cho đội tuyển quốc gia Nigeria. Anh có tên trong danh sách 23 cầu thủ của Siêu đại bàng' thi đấu ở Giải vô địch các quốc gia châu Phi 2016, dẫn dắt bởi huấn luyện viên Sunday Oliseh. Eze đã chơi tất cả các trận vòng bảng nhưng đội bị loại sớm. Anh cũng thi đấu cho đội A' tại Giải vô địch các quốc gia châu Phi 2018, nơi đội có kết quả được cải thiện, Nigeria tiến tới trận chung kết trước khi để thua chủ nhà Maroc.[12][13]

Vào tháng 5 năm 2018, anh có tên trong danh sách sơ bộ 30 cầu thủ Nigeria chuẩn bị cho Giải vô địch bóng đá thế giới 2018 ở Nga;[14] tuy nhiên, anh không có tên trong danh sách 23 cầu thủ chính thức.[15]